Directives de Soumission d'Échantillons
Séquenceur NextSeq 500
Flexible et évolutif NGS Système pour toute application
Le système de séquençage NextSeq 500 offre la puissance de séquençage à haut débit avec la rapidité, la simplicité et l'accessibilité d'un ordinateur de bureau NGS (séquençage de nouvelle génération) Le système NGS. Le flux de travail rapide, intégré, de l'échantillon aux résultats permet de nombreuses applications de séquençage—y compris les exomes, les génomes entiers et les transcriptomes—en une seule course. Ce système NGS s'intègre parfaitement dans les laboratoires de recherche, sans besoin d'équipement spécialisé. Désormais, les chercheurs peuvent réaliser n'importe quelle combinaison d'applications de séquençage à haut et moyen débit pour faire progresser leurs études.
Points forts du séquenceur NextSeq 500 :
- Vitesse et débit sans précédent : Générez 1,6 à 1,8 To en moins de 3 jours en mode double cellule de flux pour effectuer séquençage du génome entier à une échelle sans égal.
- Qualité des données exceptionnelle : La chimie de séquençage par synthèse (SBS) d'Illumina, hautement précise, offre une qualité de données éprouvée, leader dans l'industrie.
- Obtenez un séquençage d'amplicons bidirectionnel précis.
- Séquençage du génome à l'échelle de la population : Le débit quotidien le plus élevé offre une rentabilité inégalée pour les projets à l'échelle de la population.
- Plage de débit : Le NextSeq 500 permet un débit ajustable pour répondre à des besoins divers, offrant à la fois des modes Haute Production et Moyenne Production. En mode Haute Production, il peut générer jusqu'à 120 Go de données par course, adapté aux projets à grande échelle, tandis que le mode Moyenne Production peut générer jusqu'à 39 Go par course, idéal pour des projets plus petits et séquençage ciblé projets.
- Longueurs de lecture variables : Prend en charge plusieurs configurations de longueur de lecture telles que single-end 75 pb, paired-end 75 pb, single-end 150 pb et paired-end 150 pb, offrant une polyvalence pour différents besoins expérimentaux.
- Flux de travail en une étape : De la préparation des échantillons à l'analyse des données, le NextSeq 500 propose un flux de travail simplifié. Le chargement automatisé des échantillons et une interface conviviale rendent l'utilisation simple, même pour les débutants.
- Délai d'exécution rapide : Avec un temps d'exécution court de seulement 11 à 29 heures (selon le débit choisi et la longueur de lecture), le NextSeq 500 améliore considérablement l'efficacité du laboratoire.
- Haute Précision : En utilisant la technologie SBS d'Illumina, le NextSeq 500 offre un séquençage très précis. L'indexation moléculaire duale réduit encore les erreurs de séquençage, garantissant la fiabilité des données.
- Couverture approfondie : Adapté aux applications nécessitant une couverture élevée, telles que la détection de variants, l'analyse des variations du nombre de copies et l'identification de mutations rares.
Paramètres de performance du séquenceur NextSeq 500
| Sortie intermédiaire | Haute performance | |
|---|---|---|
| Cellules de flux traitées par course | 1 | 1 |
| Plage de sortie | 20-39 Go | 30-120 Go |
| Temps d'exécution | 15-26 heures | 12-30 heures |
| Lectures par cellule de flux | 130 millions | 400 millions |
| Longueur de lecture maximale | 2 × 150 pb | 2 × 150 pb |
| Qualité des données | 75 % des bases dépassent une qualité Q30 pour un séquençage de 150 pb. | |
| Applications clés | génome, exome, séquençage du transcriptome, et plus encore. | |
Applications du séquenceur NextSeq 500 :
Le NextSeq 500 est adapté à un large éventail d'applications, y compris, mais sans s'y limiter :
- Génomique Séquençage de petit génome à grande échelle séquençage de l'exome, études d'association à l'échelle du génome (GWAS).
- Transcriptomique RNA-seqanalyse transcriptomique quantitative.
- Épigénomique: ChIP-seq, ATAC-seq, séquençage de méthylation.
- Le séquenceur NextSeq 500 facilite le génotypage à haut débit par séquençage, permettant l'analyse simultanée de milliers à des millions de variants génétiques à travers les génomes.
- Recherche clinique : recherche sur le cancer, diagnostic de maladies génétiques, pharmacogénomique.
- Génotypage par séquençage
- Métagénomique
Comparaison du séquenceur NextSeq 500 et de l'Illumina NovaSeq 6000 :
| Paramètre | Séquenceur NextSeq 500 | Illumina NovaSeq 6000 |
|---|---|---|
| Plage de débit | Haute sortie : jusqu'à 120 Go/exécution \ Sortie moyenne : jusqu'à 39 Go/exécution | Jusqu'à 6000 Go/exécution |
| Longueur de lecture | Simple : 75 pb, 150 pb \ Paire : 75 pb, 150 pb | Simple : 100 pb, 150 pb, 250 pb \ Paire : 100 pb, 150 pb, 250 pb |
| Temps d'exécution | 11-29 heures | 25-40 heures |
| Efficacité des flux de travail | Flux de travail en une étape \ Chargement automatisé des échantillons | Flux de travail multi-étapes \ Chargement manuel d'échantillons |
| Qualité des données | Haute précision \ Indexation moléculaire double | Haute précision \ Technologie optique avancée |
| Polyvalence de l'application | Adapté à des applications diverses, des projets de petite à grande échelle. | Adapté aux projets à grande échelle \ et séquençage à haut débit |
Le séquenceur NextSeq 500 se présente comme un outil polyvalent et efficace pour les laboratoires de taille intermédiaire, offrant des capacités de haut débit, une simplicité d'utilisation et une qualité de données supérieure. Adapté à des applications allant de la recherche fondamentale aux études cliniques, le NextSeq 500 est une plateforme fiable qui permet aux chercheurs d'explorer les domaines complexes de l'investigation scientifique.
