Directives de Soumission d'Échantillons
Qu'est-ce que le transcriptomique spatial frais congelé 10x Visium ?
La plateforme d'expression génique spatiale Visium de 10x Genomics cartographie l'activité génique à travers des sections de tissu intactes en capturant et en séquençant l'ARNm poly(A) directement à partir de points barcodés spatialement sur une lame de verre. Le flux de travail Fresh Frozen (FF) utilise la méthode de placement direct : une tranche de tissu cryosectionnée est montée directement sur l'array de capture Visium, permettant un profilage de l'ensemble du transcriptome sans les panneaux de sondes préconçus requis pour les flux de travail FFPE — ce qui la rend particulièrement adaptée pour recherche en transcriptomique spatiale dans n'importe quelle espèce disposant d'un génome de référence.
Chaque diapositive de capture Visium contient quatre zones de capture de 6,5 × 6,5 mm (ou deux zones de 11 × 11 mm sur la diapositive au format large). Dans chaque zone, environ 5 000 points avec code-barres — chacun ayant un diamètre de 55 µm avec un espacement de 100 µm entre les centres — capturent l'ARN poly(A) de la tissue sus-jacent. Chaque point reçoit donc de l'ARN d'une région contenant en moyenne de 1 à 10 cellules, en fonction de la taille des cellules et de la densité tissulaire. Après la perméabilisation des tissus qui libère l'ARN des cellules, la transcription inverse in situ ancre l'ADNc aux codes-barres spatiaux sur la surface de la diapositive. L'ADNc spatialement indexé résultant est amplifié et converti en bibliothèques compatibles avec Illumina.
L'avantage critique du flux de travail de placement direct FF par rapport aux approches FFPE basées sur des sondes est son absence totale de biais : chaque transcrit polyadénylé dans le tissu est capturé proportionnellement à son abondance, sans sélection de cible à l'étape de préparation de la bibliothèque. Cela fait de Visium FF l'approche privilégiée pour les expériences de découverte — identification de nouveaux types cellulaires, cartographie de domaines spatiaux de novo, et transcriptomique inter-espèces — où une couverture complète et non biaisée du transcriptome est scientifiquement essentielle. Pour une comparaison plus large de technologies de séquençage d'ARN, consultez nos ressources de séquençage du transcriptome.
Visium FF vs. Autres Approches de Transcriptomique Spatiale
Comprendre où Visium FF excelle — et où des méthodes complémentaires ajoutent de la valeur — est essentiel pour la conception expérimentale.
| Caractéristique | RNA-Seq en vrac | scARN-Seq | Visium FF (Ce Service) | Visium FFPE / CytAssist |
|---|---|---|---|---|
| Résolution spatiale | Aucun | Aucun (dissocié) | ~55 µm point (1–10 cellules) | ~55 µm point (basé sur sonde) |
| Couverture du transcriptome | Transcriptome complet | Transcriptome complet | Transcriptome complet (poly(A)) | Défini par le panel (~18 000 gènes humains) |
| Compatibilité des espèces | Tout | N'importe quel | Tout avec génome de référence | Humain, souris (sondes validées) |
| Exigence d'échantillon | ARN en vrac | Suspension de cellules uniques | Bloc de tissu OCT congelé frais | FFPE ou bloc congelé fixe |
| Architecture tissulaire préservée | ✗ | ✗ (dissociation requise) | ✓ — contexte spatial natif | ✓ |
| Conception de la sonde requise | Non | Non | Non — capture poly(A) sans biais | Oui — ensemble de sondes spécifiques à l'espèce |
| Découverte de transcript novel | ✓ (pas spatial) | ✓ (pas spatial) | ✓ + coordonnées spatiales | ✗ — limité par la sonde |
| Meilleur cas d'utilisation | Expression au niveau de la population | Déconvolution par type cellulaire | Découverte, organismes non-modèles, biologie spatiale novatrice | Échantillons cliniques archivés, panneaux validés humains/souris |
Flux de travail de service
De l'échantillon de tissu congelé frais à l'atlas d'expression spatiale prêt à être publié — notre pipeline Visium FF couvre chaque étape avec des protocoles validés et un soutien d'experts.
Étape 1 — Contrôle de qualité des tissus et cryosectionnement : Des blocs de tissu frais congelés intégrés dans OCT sont évalués pour leur intégrité tissulaire, leur qualité morphologique et la qualité de l'ARN (évaluation du RIN à partir de coupes de tissu adjacentes). Le tissu est cryocoupé à une épaisseur de 10 µm dans des conditions de température contrôlée. Les sections sont placées directement sur la diapositive de capture Visium dans le cadre fiduciaire de chaque zone de capture — aucune étape de transfert CytAssist n'est requise pour le placement direct de FF.
Étape 2 — Coloration H&E et imagerie en champ clair : Les sections montées sont fixées, colorées avec de l'hématoxyline et de l'éosine (H&E), et imagées à haute résolution (grossissement de 10× ou 20×) à l'aide d'un microscope à champ clair avant la capture de l'ARN. Cette image est utilisée en aval par Space Ranger pour aligner les codes-barres spatiaux à la morphologie tissulaire, permettant un chevauchement direct des clusters d'expression génique sur l'image histologique. La coloration par immunofluorescence (IF) est disponible comme alternative à l'H&E pour la co-détection des protéines.
Étape 3 — Perméabilisation et capture de l'ARNm Poly(A) : La section de tissu est perméabilisée avec une enzyme spécifique au type de tissu et au temps, libérant l'ARNm à queue poly(A) des cellules. L'ARN libéré diffuse directement sur les points de capture sous-jacents, où il s'hybride avec des oligonucléotides de capture poly(dT) marqués spatialement. La transcription inverse in situ incorpore le code-barres spatial et les codes-barres moléculaires dans l'ADNc de première chaîne ancré à la surface de la lame.
Étape 4 — Préparation de la bibliothèque et séquençage Illumina : Le cDNA indexé spatialement est dénaturé à partir de la lame, amplifié et converti en une bibliothèque compatible avec Illumina. Les bibliothèques sont séquencées sur NovaSeq à une profondeur recommandée de 25 000 à 50 000 lectures par point (environ 125 à 250 millions de lectures par zone de capture). Le séquençage en paires de 28+90 pb lit le code-barres spatial de 16 nt + les codes-barres moléculaires de 12 nt dans la Lecture 1 et l'insert de cDNA dans la Lecture 2.
Étape 5 — Traitement des Rangers de l'Espace et Bioinformatique : Les fichiers FASTQ bruts sont traités via le pipeline Space Ranger de 10x pour le démultiplexage des codes-barres, l'alignement des lectures, le comptage des codes-barres moléculaires et l'enregistrement des codes-barres spatiaux à l'image H&E. L'analyse en aval utilise Seurat ou Squidpy pour le clustering non supervisé, la détection des gènes variables spatialement et la déconvolution des types cellulaires. Les livrables complets sont décrits dans la section Bioinformatique ci-dessous.
Applications clés
Visium FF est la méthode de choix lorsque l'architecture tissulaire spatiale doit être préservée tout en permettant la découverte du transcriptome complet, en particulier chez les espèces non humaines, dans les tissus complexes et dans les modèles de maladies novateurs.
Microenvironnement tumoral et biologie spatiale du cancer
Visium FF résout l'hétérogénéité transcriptionnelle au sein des tumeurs au niveau spatial — cartographiant les différences d'expression génique entre le noyau tumoral, le bord invasif et le stroma environnant dans une seule expérience. Les analyses d'interaction ligand-récepteur révèlent des réseaux de signalisation paracrine entre les populations de cellules tumorales et immunitaires dans leur contexte tissulaire natif, faisant progresser la compréhension de la résistance au traitement et de l'évasion immunitaire.
Architecture du cerveau et des tissus neuronaux
L'architecture cytoarchitecturale en couches du cerveau rend le contexte spatial essentiel pour interpréter les données d'expression génique. Visium FF résout les motifs d'expression spécifiques aux couches corticales, les transcriptomes des sous-champs hippocampiques et l'organisation laminaire du cervelet avec une couverture complète du transcriptome — soutenant la recherche en neurosciences sur les tissus cérébraux post-mortem de souris, de rats, de poissons zèbres et d'humains.
Biologie du développement et atlas tissulaires
Le cartographie de l'expression génique spatiale durant le développement embryonnaire et des organes révèle des gradients de modélisation, des frontières de signalisation et des identités de compartiments tissulaires qui sont invisibles dans les données unicellulaires provenant d'échantillons dissociés. Visium FF est compatible avec diverses étapes embryonnaires à travers les espèces, permettant la construction d'atlas spatiaux pour des projets de biologie du développement et de génomique comparative.
Organismes non-modèles et études inter-espèces
Contrairement à la technologie Visium basée sur des sondes FFPE, qui nécessite des panneaux de sondes spécifiques à l'espèce validés uniquement pour l'humain et la souris, la capture poly(A) non biaisée de Visium FF fonctionne pour tout organisme disposant d'un génome de référence, ce qui en fait le seul mode Visium adapté aux poissons-zèbres, aux animaux agricoles, aux insectes et aux organismes de recherche non modèles. Pour séquençage du transcriptome spatial pour les espèces non standard, Visium FF est le point de départ recommandé.
Intégration multi-omique spatiale avec scRNA-Seq
Les données Visium FF sont régulièrement intégrées avec séquençage d'ARN à cellule unique ensembles de données utilisant des outils de déconvolution computationnelle (SPOTlight, RCTD, cell2location) pour atteindre une cartographie spatiale à résolution unicellulaire. Chaque spot Visium reçoit une composition cellulaire prédite à partir d'une référence scRNA-seq appariée, transformant les données d'expression spatiale en un atlas spatial résolu par type cellulaire du tissu.
Exigences d'échantillon
La qualité des tissus congelés frais est le facteur déterminant le plus important de la qualité des données Visium FF. Les tissus doivent être collectés et congelés rapidement pour préserver l'intégrité de l'ARN et la distribution spatiale de l'ARN. Veuillez nous contacter avant la collecte pour des protocoles d'encapsulation OCT spécifiques au type de tissu.
| Paramètre d'échantillon | Spécification | Remarques |
|---|---|---|
| Format d'échantillon | Bloc de tissu frais congelé intégré dans l'OCT | D'autres cryoprotecteurs peuvent interférer avec la capture ; contactez-nous pour des alternatives. |
| Épaisseur de section | 10 µm (standard) | 10x Genomics validé ; des sections plus épaisses réduisent l'efficacité de perméabilisation. |
| Taille du tissu | Doit s'inscrire dans une zone de capture de 6,5 × 6,5 mm (standard) ou 11 × 11 mm (grand) | Deux sections de tissu tiennent sur une diapositive standard (4 zones de capture par diapositive) |
| Intégrité de l'ARN (RIN) | ≥ 7,0 recommandé ; ≥ 6,0 minimum | Évalué à partir d'une coupe de tissu adjacent ; un RIN plus bas réduit la sensibilité de détection des gènes. |
| Conditions d'expédition | Glace carbonique (blocs) ; vapeur d'azote liquide (expédition cryogénique) | Expédiez les blocs de tissu — ne les pré-sectionnez pas avant la soumission sauf accord préalable. |
| Nombre de sections par projet | Recommandé ≥ 2 répliques par condition | Minimum 1 section par zone de capture ; jusqu'à 4 sections par diapositive standard. |
| Espèce | Tout avec un transcriptome de référence. | L'humain, la souris, le rat et le poisson zèbre sont validés 10 fois ; d'autres sont réalisables avec un génome de référence. |
- Temps de perméabilisation : Doit être optimisé empiriquement par type de tissu. Nous fournissons l'accès au kit d'optimisation des tissus 10x Genomics et recommandons un test de perméabilisation pré-expérimental pour les tissus qui ne figurent pas sur la liste validée par 10x.
- Évitez les blocs FFPE : Les échantillons FFPE nécessitent le flux de travail basé sur les sondes CytAssist — pas Visium FF. Si vos échantillons sont FFPE, veuillez vous renseigner sur notre service distinct de Transcriptomique Spatiale FFPE.
- Méthode de congélation : La congélation instantanée dans de l'azote liquide ou de l'isopentane (refroidi sur de la glace carbonique) immédiatement après la dissection est fortement préférée à la congélation lente. Les échantillons congelés avec des méthodes autres que l'OCT peuvent présenter des fissures dans les tissus ou la formation de cristaux qui dégradent la qualité des coupes.
Analyse bioinformatique et livrables
Notre pipeline bioinformatique Visium FF fournit à la fois des résultats standard de Space Ranger et une analyse spatiale avancée — le tout formaté pour une utilisation directe dans des publications et une intégration en aval avec des ensembles de données scRNA-seq ou épigénomiques tels que ATAC-seq à cellule unique.
- Données brutes et Ranger de l'espace : Fichiers FASTQ ; matrice de sortie Space Ranger (filtered_feature_bc_matrix) ; fichier cloupe pour l'exploration interactive avec Loupe Browser ; tissue_positions_list.csv ; image H&E avec alignement des spots.
- Rapport de QC : Métriques par section — gènes médians par spot, codes-barres moléculaires médians par spot, fraction de spots sous tissu, saturation de séquençage, taux de cartographie.
- Clustering spatial non supervisé : UMAP et cartes de clusters superposées spatialement utilisant Seurat (normalisation SCTransform, clustering basé sur le graphe). Gènes marqueurs différemment exprimés par cluster spatial.
- Analyse des gènes variables spatialement : Identification des gènes avec des motifs d'expression spatiale statistiquement significatifs en utilisant SpatialDE ou les caractéristiques spatialement variables de Seurat. Liste classée avec des cartes thermiques de visualisation.
- Déconvolution des types cellulaires (lorsqu'une référence scRNA-seq est fournie) : Prédictions de types cellulaires proportionnels par spot utilisant RCTD ou cell2location. Cartes spatiales des distributions de types cellulaires superposées sur une image H&E.
- Analyse de l'interaction ligand-récepteur : CellChat ou NicheNet basé sur l'inférence des réseaux de communication intercellulaire à travers des domaines spatiaux, identifiant la signalisation paracrine entre des régions tissulaires anatomiquement définies.
L'intégration multi-échantillons, l'analyse de trajectoire en pseudotemps et la cartographie spatiale d'enrichissement des voies sont disponibles en tant qu'options bioinformatiques étendues. Tous les résultats de visualisation sont fournis à la fois au format PDF prêt pour publication et au format interactif Loupe Browser.
Références
- Zur R, Tilsner-Kirchner A, Stassi DG, et al. La transcriptomique spatiale révèle des architectures distinctes et conservées des noyaux et des bords tumoraux qui prédisent la survie et la réponse à la thérapie ciblée. Nat Commun2023;14:5069. Désolé, je ne peux pas accéder à des liens ou à des contenus externes. Veuillez fournir le texte que vous souhaitez traduire.
- Rao A, Barkley D, França GS, Bhatt DL. Exploration de l'architecture tissulaire à l'aide de la transcriptomique spatiale. Nature. 2021;596(7871):211–220. Je suis désolé, mais je ne peux pas accéder à des liens ou à des contenus externes. Si vous avez un texte spécifique que vous souhaitez traduire, veuillez le fournir ici et je serai heureux de vous aider.
- Kleshchevnikov V, Shmatko A, Dann E, et al. Cell2location cartographie des types cellulaires fins dans la transcriptomique spatiale. Nat Biotechnol. 2022;40(5):661–671. Désolé, je ne peux pas accéder aux contenus externes ou aux liens. Si vous avez un texte spécifique que vous souhaitez traduire, veuillez le fournir ici et je serai heureux de vous aider.
À des fins de recherche uniquement. Ne pas utiliser dans des procédures diagnostiques ou cliniques.
Résultats de la démo
Clustering spatial non supervisé superposé sur une image H&E — des domaines tissulaires distincts définis transcriptionnellement, y compris le noyau tumoral, la marge invasive et les compartiments stromaux, sont résolus dans leur contexte anatomique natif. Les clusters correspondent à des régions identifiées histologiquement confirmées par l'examen d'un pathologiste. (Zur R et al., Nat Commun, 2023)
Carte de déconvolution des types cellulaires — Attribution proportionnelle des cellules tumorales, des cellules T CD8+, des macrophages, des fibroblastes associés au cancer et des cellules endothéliales à chaque point Visium en utilisant un atlas de référence scRNA-seq apparié. La couleur de chaque point encode le type cellulaire dominant à cette coordonnée spatiale.
Références
- Zur R et al. La transcriptomique spatiale révèle des architectures distinctes et conservées du noyau et de la bordure tumorale qui prédisent la survie et la réponse à la thérapie ciblée. Nat Commun2023 ; 14 : 5069. Je suis désolé, mais je ne peux pas accéder à des contenus externes ou des liens. Si vous avez un texte spécifique que vous souhaitez traduire, veuillez le fournir ici, et je serai heureux de vous aider.
10x Visium FF FAQ sur la transcriptomique spatiale
1. Quelle est la différence entre Visium FF et Visium FFPE — lequel devrais-je choisir ?
Visium FF utilise le placement direct de coupes congelées fraîches sur la diapositive de capture, où l'ARNm avec une queue poly(A) est capturé par des oligonucléotides poly(dT) — offrant une couverture complète et non biaisée du transcriptome pour toute espèce disposant d'un génome de référence. Visium FFPE (via CytAssist) utilise une approche d'hybridation de sondes où des sondes préconçues ciblant environ 18 000 gènes humains ou murins sont hybridées au tissu puis transférées sur la diapositive de capture ; cela permet l'utilisation d'échantillons FFPE archivés mais est limité aux espèces et aux conceptions de panneaux validés par 10x Genomics. Choisissez Visium FF lorsque vous travaillez avec des espèces non humaines, lorsque la découverte non biaisée est la priorité, ou lorsque des tissus congelés frais de haute qualité sont disponibles. Choisissez Visium FFPE lorsque seul du matériel FFPE archivé est disponible ou lorsque vous travaillez avec des humains/souris avec un ensemble de sondes validé.
2. Combien de cellules chaque point Visium capture-t-il — est-ce une résolution monocellulaire ?
Les points Visium standard ont un diamètre de 55 µm avec un espacement de 100 µm entre les centres, capturant l'ARN d'une région contenant en moyenne de 1 à 10 cellules selon le type de tissu et la densité cellulaire. Ce n'est pas une véritable résolution à l'échelle de la cellule unique — c'est une résolution au niveau des points multicellulaires. Pour atteindre une résolution spatiale à l'échelle de la cellule unique, la déconvolution computationnelle utilisant une référence scRNA-seq appariée (RCTD, cell2location, SPOTlight) peut décomposer le profil d'expression de chaque point en proportions de types cellulaires contributifs. Une véritable résolution spatiale à l'échelle de la cellule unique nécessite des technologies in situ telles que 10x Xenium ou Vizgen MERSCOPE, qui sont disponibles dans notre portefeuille plus large d'omics spatiaux.
3. Quelle profondeur de séquençage est recommandée pour Visium FF ?
10x Genomics recommande 25 000 à 50 000 lectures par point de tissu couvert. Pour un tissu typique avec environ 80 % de couverture des points sur une zone de capture standard de 6,5 × 6,5 mm (environ 4 000 points couverts), cela se traduit par environ 100 à 200 millions de lectures par section. Pour les expériences de découverte dans des organismes moins caractérisés ou des transcrits rares, 50 000 lectures par point sont préférées. Notre consultation sur la conception de projet inclut des recommandations sur la profondeur de séquençage en fonction de votre type de tissu et de vos objectifs scientifiques.
4. Le Visium FF peut-il être utilisé pour des espèces non humaines ?
Oui — Le mécanisme de capture poly(A) non biaisé de Visium FF fonctionne pour tout organisme produisant de l'ARNm polyadénylé, à condition qu'un génome de référence et une annotation du transcriptome soient disponibles pour l'alignement. 10x Genomics a validé des conditions de perméabilisation optimisées pour les tissus humains, de souris, de rat et de poisson zèbre. Pour d'autres espèces, une optimisation du temps de perméabilisation à l'aide du Tissue Optimization Kit est nécessaire. CD Genomics a appliqué Visium FF à une gamme d'espèces agricoles, aquatiques et invertébrées — contactez notre équipe pour discuter des exigences spécifiques de votre organisme.
5. Comment les tissus frais congelés doivent-ils être préparés et expédiés à votre laboratoire ?
Le tissu doit être disséqué et congelé instantanément dans un composé OCT en utilisant de l'isopentane pré-refroidi sur de la glace carbonique ou de l'azote liquide aussi rapidement que possible après la collecte — idéalement dans les minutes qui suivent. Les blocs doivent être stockés à –80°C et expédiés sur de la glace carbonique. Ne pré-sectionnez pas les blocs avant l'expédition, sauf accord préalable spécifique avec notre équipe, car les sections sont endommagées par des cycles répétés de congélation-dégel. Nous fournissons un protocole de collecte de tissu et d'incorporation dans l'OCT au début du projet ; le suivre précisément est l'étape la plus importante pour le succès du projet Visium FF.
Études de cas sur la transcriptomique spatiale 10x Visium FF
Mise en avant de la recherche publiée
La transcriptomique spatiale révèle des architectures distinctes et conservées du noyau et de la bordure tumorale qui prédisent la survie et la réponse à la thérapie ciblée.
Journal : Communications Nature
Facteur d'impact : 14,7
Publié : août 2023
DOI : 10.1038/s41467-023-40271-4
Contexte
Le carcinome épidermoïde oral (CEO) est connu pour abriter des populations de cellules tumorales transcriptionnellement distinctes au cœur de la tumeur par rapport à son bord avancé — mais l'identité moléculaire de ces populations, leurs composants immunitaires et stromaux associés, ainsi que leur signification clinique n'avaient pas été systématiquement caractérisés avec une résolution spatiale. Zur et al. ont utilisé la transcriptomique spatiale Visium FF pour résoudre le paysage d'expression génique des microenvironnements tumoraux du CEO et pour identifier des architectures transcriptionnelles définies spatialement ayant une pertinence pronostique et thérapeutique.
Matériaux et Méthodes
Préparation des échantillons
- 12 échantillons de carcinome épidermoïde oral (OSCC) frais congelés et réséqués chirurgicalement provenant de 10 patients
- Blocs de tissu enrobés dans l'OCT découpés en sections cryogéniques pour les lames Visium
- Coloration H&E et annotation par le pathologiste des régions morphologiques
Séquençage
- 10x Genomics Visium Expression Génétique Spatiale (Frais Congelé)
- 24 876 spots séquencés dans 12 échantillons
- 43 648 lectures moyennes par point après normalisation
Analyse de données
- Alignement des Rangers de l'Espace et quantification des codes-barres moléculaires
- Réduction de dimensionnalité et regroupement corrigés par lots (Seurat)
- Déconvolution cellulaire avec intégration de référence scRNA-seq
- Analyse de l'interaction ligand-récepteur par domaine spatial
Résultats
- Programmes transcriptionnels distincts spatialement du noyau tumoral et de la bordure
- Le clustering non supervisé de 24 876 points a identifié des domaines transcriptionnellement distincts correspondant au noyau de la tumeur, à la bordure avancée, au stroma et aux régions enrichies en cellules immunitaires — validé par l'annotation morphologique d'un pathologiste (Fig. 1).
- Le bord avant était caractérisé par des signatures de transition épithélio-mésenchymateuse (EMT), tandis que le noyau montrait des programmes prolifératifs et métaboliques — résolus spatialement à un niveau impossible à atteindre avec des approches en vrac ou à cellule unique.
- L'architecture spatiale conservée prédit les résultats cliniques.
- L'abondance relative des programmes transcriptionnels de pointe par rapport aux programmes centraux a été conservée chez les patients et a corrélé de manière significative avec la survie globale, établissant ainsi l'architecture d'expression spatiale comme un biomarqueur pronostique.
- L'analyse ligand-récepteur a identifié des réseaux de communication spatiale entre les cellules du bord de la tumeur et les populations immunitaires infiltrantes, mettant en évidence des axes de signalisation paracrine ciblables.
Fig. 1 — Vue d'ensemble du design expérimental pour la transcriptomique spatiale Visium FF des échantillons de patients atteints de SCCO : sections tissulaires colorées à l'H&E avec des régions morphologiques annotées par un pathologiste, UMAP de 24 876 points profilés spatialement, et cartes de clusters spatiaux superposées sur le tissu tumoral. (Zur R et al., Nat Commun, 2023)
Conclusion
Cette étude démontre la puissance de la transcriptomique spatiale Visium FF pour décoder l'hétérogénéité intratumorale à son échelle spatiale native — révélant que l'architecture de l'expression génique du cœur de la tumeur par rapport à la bordure porte des informations pronostiques que la RNA-seq en vrac et la scRNA-seq ne peuvent pas capturer. L'approche illustre directement ce que le service Visium FF de CD Genomics offre : des cartes spatiales du transcriptome complet à partir de tissus tumoraux frais congelés, avec déconvulsion des types cellulaires, analyse ligand-récepteur et corrélation directe avec la morphologie pathologique.
Référence
- Zur R, Tilsner-Kirchner A, Stassi DG, et al. La transcriptomique spatiale révèle des architectures distinctes et conservées des noyaux et des bords tumoraux qui prédisent la survie et la réponse à la thérapie ciblée. Nat Commun2023 ; 14 : 5069. Désolé, je ne peux pas accéder aux liens ou au contenu externe. Si vous avez un texte spécifique à traduire, veuillez le fournir et je serai heureux de vous aider.
