Directives de Soumission d'ÉchantillonsDirectives de Soumission d'Échantillons Directives de Soumission d'Échantillons
Commander en ligne
×
Demande de devis
! À des fins de recherche uniquement, non destiné à un diagnostic clinique, un traitement ou des évaluations de santé individuelles.

Services de séquençage Oxford Nanopore — Longs lectures et en temps réel

Lectures longues, analyses en temps réel et détection de modifications natives. La plateforme de séquençage Oxford Nanopore de CD Genomics offre des solutions flexibles, rapides et complètes pour les études de génome, de transcriptome et d'épigénome.

Ce que nous proposons:

  • Séquençage du génome entier (standard et ultra-long), ARN direct, profilage de transcrits complets/lncRNA
  • Séquençage ciblé (capture Cas9 ou échantillonnage adaptatif) et panneaux d'amplicons
  • Support de projet de bout en bout : préparation de la bibliothèque → séquençage → bioinformatique → rapports prêts à être publiés

Problèmes que nous résolvons:

  • Résoudre les répétitions et les variants structurels ; assembler des génomes complexes avec des lectures longues et ultra-longues.
  • Détecter 5mC/6mA et analyser directement l'ARN natif (sans bisulfite/RT)
  • Prenez des décisions critiques en temps réel grâce à des tableaux de bord de rendement et de contrôle qualité.

Confiance: QC basé sur SOP · FASTQ plus FAST5/POD5 optionnels · conception d'étude consultative

Directives de soumission d'échantillons
Obtenez votre devis instantané
Obtenez votre devis instantané

Table des matières

    Technologie et principe du séquençage par nanopore

    Ce que c'est (technologie de séquençage par nanopore) :

    Le séquençage Oxford Nanopore détecte les changements de courant ionique à mesure que des molécules d'ADN ou d'ARN uniques passent à travers des nanopores conçus, intégrés dans une membrane. Chaque contexte de séquence courte (k-mer) produit un signal caractéristique ("squiggle"). Ces signaux sont transmis à MinKNOW, où le basecaller basé sur un réseau de neurones Dorado les convertit en bases en temps réel. Étant donné que la molécule est lue directement, des caractéristiques natives—telles que la méthylation de l'ADN 5mC/6mA ou les modifications de l'ARN—peuvent être déduites du signal sans traitement au bisulfite ni transcription inverse.

    Comment fonctionne le séquençage par nanopore (principe) :

    Une protéine motrice guide l'ADN/ARN simple brin à travers un pore à un rythme contrôlé.

    2. Comme chaque k-mer se trouve dans la constriction du pore, il module le courant ; des milliers d'événements sont enregistrés par seconde.

    3. Dorado décode le squiggle en lectures FASTQ ; des fichiers de signal brut optionnels (FAST5/POD5) conservent les informations de modification pour une analyse ultérieure.

    4. Parce que les données arrivent en continu, les séries peuvent être arrêtées ou prolongées à la demande pour atteindre le rendement/la qualité cible.

    Pourquoi cela importe pour la recherche :

    • Des lectures ultra-longues (de centaines de kb à des classes de Mb) couvrent les répétitions, les variants structurels, les télomères/centromères.
    • La prise de décision en temps réel accélère les projets sensibles au temps et optimise l'utilisation des cellules de flux.
    • La détection directe de l'ARN et des modifications natives ouvre des études épigénétiques et transcriptomiques avec un biais minimal.

    Nos services de séquençage Nanopore

    Séquençage de transcrits complets par nanopore

    Une ligneTranscriptomique au niveau des isoformes avec des longues lectures pour une détection précise des épissages, des TSS/TES et des fusions.

    Meilleur pourDécouverte/quantification des isoformes pleines longueur dans les gènes codants ; appel de fusions.

    Voir les détails de la transcription complète →

    Séquençage d'ARN direct par nanopore

    Une ligneSéquence ARN natif directement—conserver les signaux de modification sans transcription inverse.

    Meilleur pourRecherche sur la modification de l'ARN et profilage du transcriptome avec un biais minimal.

    Explorer le séquençage direct de l'ARN

    Séquençage d'amplicons par nanopore

    Une ligneDétection rapide et ciblée des variants à travers des loci définis avec de longs amplicons.

    Meilleur pourValidation de panel, dépistage de points chauds, vérifications de clones, études sur de petites cohortes.

    Voir le flux de travail de séquençage d'amplicons →

    Séquençage LncRNA à longueur complète par nanopore

    Une ligneRésoudre les isoformes de longs ARN non codants que les méthodes de séquençage à court terme manquent.

    Meilleur pourstructure de l'lncRNA, utilisation des isoformes, découverte de nouveaux transcrits.

    Voir les détails de séquençage des lncRNA →

    Séquençage ciblé par nanopore (Cas9 ou Échantillonnage Adaptatif)

    Une ligneConcentrez-vous sur la couverture là où cela compte—Capture de Cas9 ou piloté par logiciel échantillonnage adaptatif.

    Meilleur pourAnalyse des variantes/méthylations spécifiques au locus sans coût de séquençage du génome entier.

    Explorer les options ciblées (Cas9/Adaptatif) →

    Séquençage ultra-long par nanopore

    Une ligneMaximiser la longueur de lecture (de centaines de ko à des classes de Mo) pour les assemblages et les répétitions complexes.

    Meilleur pourAssemblages de novo, grandes variations structurelles, télomères/centromères, expansions de répétitions.

    Voir le flux de travail WGS ultra-long →

    Service Pore-C

    Une ligneContacts chromatin à longue portée et échafaudage utilisant des lectures de nanopores.

    Meilleur pourOrganisation du génome en 3D, support de scaffolding pour les assemblages.

    Voir les détails du service Pore-C →

    Service Iso-Seq TAIL

    Une ligneCartographie TSS/TES à molécule unique et profilage de la longueur de la queue poly(A).

    Meilleur pour: Transcription de fin, complétude des isoformes, études de régulation post-transcriptionnelle.

    Explorer les résultats TAIL Iso-Seq →

    Ce que vous recevrez

    Chaque projet Oxford Nanopore est livré avec des données transparentes, une documentation détaillée et des métriques de contrôle qualité reproductibles, garantissant une confiance prête pour la publication.

    Fichiers de données principaux (pour chaque projet)

    • FASTQ (.fastq.gz) — lectures de base appelées (Dorado).
    • Signal brut optionnel — FAST5/POD5 sur demande pour une réanalyse sensible aux modifications.
    • Mémo de projet — le protocole de séquençage par nanopore utilisé (kit de bibliothèque, cellule de flux/chimie, paramètres de course), ainsi que les versions de logiciels et les paramètres.

    Exécuter et vérifier le rapport (par échantillon et par code-barres)

    • Rendement et débit : total des lectures/bases ; comptes de réussite/échec.
    • Métriques de longueur de lecture : N50/N90, histogrammes de longueur.
    • Qualité : distribution des scores Q, résumés de précision de lecture.
    • Performance de codage-barres : taux d'attribution, équilibre entre les échantillons.
    • Si aligné : taux de correspondance, uniformité de couverture/duplications, résumés on-/off-target (pour ciblé/amplicon).
    • Si applicable : utilisation des pores au fil du temps et notes de fonctionnement pour soutenir les dossiers d'étude.

    Sorties d'analyse optionnelles (Choisir par service)

    Application Livrables
    Génomes (WGS Standard / Ultra-Long)
    • Assemblage de novo (FASTA / GFA) avec des statistiques (N50, NG50, BUSCO ou QC k-mer si applicable)
    • Ensembles de variantes : SNV / indel / SV au format VCF avec des instantanés de preuves de soutien.
    • Haplotypes phasés optionnels sur demande
    Épigénétique (Méthylation de l'ADN)
    • Tables d'appel 5mC / 6mA par site (bedMethyl / TSV)
    • Résumé des régions différentiellement méthylées (DMR)
    • Rapports d'enrichissement de motifs et d'analyse de contexte
    Transcription (Transcription complète / lncRNA / ARN direct / TAIL Iso-Seq)
    • Catalogue des isoformes (GTF / GFF3)
    • Tableaux de quantification d'expression
    • Liste des transcrits de fusion
    • Sites de début de transcription (TSS) / sites de terminaison (TES) et graphiques de distribution de la queue poly(A) (pour les flux de travail TAIL)
    Amplicon / Ciblé (Cas9 ou Échantillonnage Adaptatif)
    • Résumé de la validation des séquences de primers / guides
    • Séquences de consensus par amplicon
    • Fichier d'appel de variantes (VCF) avec des estimations de fréquence allélique
    • Tableaux récapitulatifs de la couverture ciblée / non ciblée
    Génome 3D (Pore-C)
    • Matrices de contact traitées (.cool / .mcool / .hic)
    • Tableaux récapitulatifs Loop et TAD
    • Pistes de visualisation du navigateur génomique (bigWig / bigBed)

    Protocole de séquençage par nanopore

    Infographic showing six steps of the Nanopore Sequencing Protocol with icons for Intake & QC, Library Prep, Flow Cell & Barcodes, Basecalling and Demux, Post-run QC, and Documentation.

    • Entrée et contrôle qualité: Qubit quant; A260/280 ~1,8–2,0, A260/230 ≥2,0. gDNA HMW pour Ultra-Long ; RIN RNA ≥8.
    • Préparation de bibliothèque (par application): Standard WGS; Ultra-long (manipulation douce HMW) ; Amplicon ; Ciblé (Cas9 ou échantillonnage adaptatif) ; cDNA/lncRNA pleine longueur ; RNA direct ; Pore-C ; TAIL Iso-Seq.
    • Cellule de flux et codes-barres: Dimensionné pour produire/cibles ; équilibre des entrées avec codes-barres.
    • Séquençage et contrôle1–72 h typique ; surveillance en direct ; arrêter/étendre ou recharger si nécessaire ; activer l'échantillonnage adaptatif lorsque cela est pris en charge.
    • Basecalling et démultiplexage: MinKNOW + Dorado → FASTQ ; FAST5/POD5 optionnels pour une réanalyse sensible aux modifications.
    • Contrôle qualité post-course: rendement/réussite-échec ; longueur de lecture N50/N90 ; distribution des scores de qualité ; cartographie/couverture et ciblé/non ciblé (si aligné).
    • Documentation et passation: mémo de protocole (kits/chimie/logiciel), rapport de CQ, résultats d'analyse ciblée ; appel de révision optionnel.

    Bioinformatique et analyse de données

    Notre service propose une technologie de séquençage par nanopores complète, ainsi que du soutien en bioinformatique et des applications pour les données de lecture longue d'Oxford Nanopore.

    Bioinformatique Standard

    • Basecalling et démultiplexage : Dorado/MinKNOW pour produire des fichiers FASTQ par échantillon.
    • Exécuter les tableaux de bord QC : rendement, longueur de lecture N50, distribution des scores Q, équilibre des codes-barres.
    • Préparation de lecture : découpage des adaptateurs/amorces, filtrage.
    • Alignement de référence (facultatif) : cartographie prenant en compte les longues lectures avec des résumés de couverture ; BAM/CRAM si demandé.
    • Conservation du signal (optionnel) : POD5/FAST5 préservé pour une réanalyse consciente des modifications.

    Analyse avancée

    • Assemblage de génome de novo — première lecture longue ou hybride ; assemblages polis avec des statistiques de continuité.
    • Variation structurelle (SV) et appel de CNV — grands indels, inversions, translocations ; résumés du nombre de copies.
    • Analyse et quantification des transcrits complets (isoformes) — découverte d'isoformes, tableaux d'expression, détection de fusions.
    • Analyse des modifications de l'ADN/ARN (épigénétique) — 5mC/6mA de qualité recherche ; résumés des signaux modifiés de l'ARN pour l'ARN direct.
    • Classification métagénomique — profilage taxonomique ; support d'assemblage lorsque cela est applicable.
    • (Add-ons) Appels de consensus et de variantes ciblés/amplicon, cartes de contact du génome 3D Pore-C.

    Applications de séquençage par nanopore

    Où le séquençage Oxford Nanopore apporte le plus de valeur dans la recherche :

    Assemblage et finition de génomes de novo

    Répétitions de spans et régions complexes ; résoudre les télomères/centromères.

    Services recommandés : Séquençage ultra-long, séquençage standard de lectures longues WGS.

    Variation structurelle (SV) et réarrangements complexes

    Détecter les grandes insertions/délétions, inversions, translocations, expansions de répétitions.

    Services recommandés : Ultra-long/standard WGS, ciblé (Cas9/adaptatif).

    Phasage des haplotypes et analyse spécifique des allèles

    De longues molécules préservent le lien entre des variantes éloignées.

    Services recommandés : WGS standard/ultra-long.

    Transcriptomique complète (isoformes et fusions)

    Identifier des isoformes novateurs, quantifier leur utilisation, confirmer les fusions ; cartographier les TSS/TES.

    Services recommandés : Séquençage de transcriptome complet, séquençage de lncRNA, TAIL Iso-Seq.

    Études sur l'ARN direct et les modifications de l'ARN

    Séquençage de l'ARN natif sans RT ; enquête sur les signaux associés aux modifications.

    Service recommandé : Séquençage direct de l'ARN.

    Méthylation de l'ADN / épigénétique (5mC/6mA)

    Appeler les modifications du signal pour construire des cartes de méthylome et des DMR.

    Services recommandés : WGS standard/ultra-long, ciblé (Cas9/adaptatif).

    Découverte et validation des cibles

    Enrichissez rapidement les loci d'intérêt sans le coût d'un génome complet.

    Services recommandés : Séquençage par nanopore ciblé (Cas9 ou échantillonnage adaptatif), séquençage d'amplicons.

    architecture du génome 3D

    Générez des cartes de contact à longue portée pour l'échafaudage et les études de chromatine.

    Service recommandé : Pore-C.

    Métagénomique et surveillance des pathogènes

    Améliorer la résolution d'assemblage/de contrainte ; bénéficier de décisions en temps réel.

    Services recommandés : WGS standard, ciblé, amplicon (par conception).

    Pour des cohortes de petites variantes à haute profondeur, le séquençage à lecture courte peut être rentable ; les conceptions hybrides (lecture courte + Nanopore) capturent à la fois la profondeur et le contexte à longue portée.

    Séquençage Nanopore vs Illumina vs PacBio (HiFi)

    Choisir la bonne plateforme ? Voici une vue concise et prête à l'emploi des séquençages par nanopore, Illumina et PacBio (HiFi) pour une utilisation en recherche. La comparaison ci-dessous vous aide à sélectionner la bonne plateforme pour la conception de votre étude.

    Dimension Oxford Nanopore (ONT) PacBio (HiFi/SMRT) Illumina (SBS)
    Principe Signal de courant ionique à travers des nanopores ; appel de base NN (Dorado) Détection optique dans les ZMW ; consensus circulaire (HiFi) Séquençage par synthèse ; imagerie optique
    Longueur de lecture (typique) Long; ultra-long jusqu'à la classe Mb possible (flux de travail UL) Long ; Les lectures HiFi sont généralement d'environ 15 à 20 ko. Lectures courtes, généralement jusqu'à 2×300 pb
    Temps de données Diffusion en temps réel ; arrêt/extension des exécutions à la demande Lot (consensus après exécution) Lot
    Biologie native ARN direct ; modifications de l'ADN natif (5mC/6mA) à partir du signal Modifications de l'ADN via des signatures cinétiques ; ARN via l'ADNc. Aucune détection de mod natif (flux de travail standard)
    paradigme de précision Amélioration brute ; fort consensus avec profondeur/finition Précision de consensus élevée par lecture (HiFi) Haute précision par base à grande échelle
    Là où il brille Ultra-long portée de répétitions/SV ; travail rapide/de terrain ; méthylation ; ARN direct Précision des longues lectures pour les variants et les régions difficiles Grandes cohortes ; profondeur des petites variantes rentable
    Compromis Informatique consciente du signal ; coût par Go vs lecture courte Plateforme optique ; coût de l'instrument/chemie Contexte à long terme limité ; pas de mods natifs

    Choix rapide (règles pratiques) :

    • Besoin des molécules les plus longues. (assemblages, télomères/répétitions) : choisir Nanopore Ultra-Long.
    • Besoin de la plus haute précision par lecture dans les longues lectures. prêt à l'emploi PacBio HiFi; ou ONT avec consensus/polissage selon l'objectif.
    • Besoin d'appels de modification natifs ou d'ARN direct: Séquençage Oxford Nanopore.
    • Grandes cohortes avec un appel de SNV/indel approfondi Illumina; ajouter des lectures longues pour résoudre des loci complexes.
    • Projets critiques en temps ou sur le terrain Nanopore (contrôle en temps réel).
    • Conceptions hybrides: combiner les lectures courtes et les lectures longues (ou HiFi et ONT) pour équilibrer précision, coût et contexte à long terme.

    La performance réelle dépend de l'intégrité de l'échantillon, du type de bibliothèque, de la chimie, de la profondeur et du pipeline d'analyse.

    Qualité et conception de l'étude

    • Répliques et ContrôlesRecommandez ≥2 réplicats biologiques par condition ; incluez des témoins négatifs pour les amplicons/ciblés ; des ajouts facultatifs pour la méthylation.
    • Planification de la couverture: Ajustez la profondeur de lecture longue à la complexité du génome/objectifs SV ; prévoyez la profondeur ciblée pour le ciblage/amplicon ; dimensionnez les lectures/échantillon pour les isoformes ou l'ARN direct.
    • Critères d'acceptation: Objectifs préétablis pour le rendement par code-barres, fraction conforme, taux de cartographie et profil de longueur de lecture (par exemple, objectifs N50 pour Ultra-Long).
    • Décisions à l'exécutionUtilisez des tableaux de bord en temps réel pour arrêter/étendre/recharger efficacement ; documentez toute variation dans le mémo du projet.

    Infographic titled 'Quality and Study Design' showing icons for Replicates and Controls, Coverage Planning, Run-Time Decisions, and Acceptance Criteria.

    L'avantage de CD Genomics

    1

    Ciblage axé sur les applications

    Mappez votre question biologique au bon service Oxford Nanopore (Ultra-Long, Direct RNA, Transcript/lncRNA complet, Ciblé/Cas9 ou adaptatif, Amplicon, Pore-C, TAIL Iso-Seq).

    2

    Modélisation de conception et faisabilité

    Modélisation de la couverture, équilibre des codes-barres et vérifications de la faisabilité des cibles/amorces avant de vous engager.

    3

    Analytique reproductible

    Pipelines conteneurisés/verrouillés par version ; emballage de résultats propre avec rapport d'analyse et dictionnaire de données.

    4

    Efficacité de course en temps réel

    Tableaux de bord en direct pour arrêter/étendre/recharger lorsque les objectifs sont atteints ; échantillonnage adaptatif lorsque cela est approprié.

    5

    Intégrité et sécurité des données

    Dossiers structurés, vérification des sommes de contrôle et transfert sécurisé avec une politique de conservation définie.

    6

    Soutien de niveau publication

    Assistance optionnelle pour la présentation des résultats, la préparation de figures/tableaux et l'aide à la rédaction/revue du manuscrit.

    7

    Neutralité multiplateforme

    Orientation objective sur les situations où les stratégies hybrides (courtes lectures + ONT, ou HiFi + ONT) apportent de la valeur.

    Exigences d'échantillon

    Service Montant d'entrée et intégrité Pureté (directives) Stockage / Expédition Notes clés
    Séquençage de transcrits complets par nanopore (cDNA) ≥500 ng–1 µg d'ARN total ; RIN ≥8 ARN A260/280 ~2,0 ; A260/230 ≥2,0 Glace carbonique (−80 °C) cDNA sensible au brin ; Poly(A)+ ou déplétion de l'ARNr selon le design
    Séquençage d'ARN direct par nanopore ≥500 ng d'ARN poly(A)+ (ou 1 à 5 µg d'ARN total pour l'enrichissement)* ; haute intégrité ARN A260/280 ~2,0 ; A260/230 ≥2,0 Glace carbonique Préserver les modifications natives ; manipulation douce ; éviter la RNase ; pas de RT.
    Séquençage d'amplicons par nanopore ≥50–200 ng d'amplicons regroupés (≈300 pb–10 kb) PCR propre ; pas de dimères de primers 4 °C ; pack de froid Fournissez un tableau de base et une liste cible ; nous pouvons concevoir si nécessaire.
    Séquençage lncRNA complet par nanopore ≥1 µg d'ARN total ; RIN ≥8 ARN A260/280 ~2,0 ; A260/230 ≥2,0 Glace carbonique Enrichir le long transcript si nécessaire ; DNase si besoin.
    Séquençage ciblé par nanopore — Cas9 ≥1–2 µg d'ADNg de haute qualité (non réticulé ; fragments longs préférés) ADN A260/280 1,8–2,0 ; A260/230 ≥2,0 (quantifié par Qubit) 4 °C court ; expédier à −20 °C avec des packs de glace Fournir des cibles/ARNg ; nous réalisons une modélisation de spécificité in silico et de ciblage.
    Séquençage ciblé par nanopore — Échantillonnage adaptatif ≥1–2 µg d'ADNg ; enrichi en fragments longs utile Identique à ce qui précède. Identique à ce qui précède Fournir le BED/FASTA des régions enrichies/déplétées ; pas de capture supplémentaire en laboratoire humide.
    Séquençage ultra-long par nanopore ≥3–5 µg d'ADNg HMW ; longueur modale >100 kb ; cisaillement minimal ADN A260/280 1,8–2,0 ; A260/230 ≥2,0 4 °C court ; navire −20 °C Pas de vortexage ; embouts à large ouverture ; éviter le phénol/EDTA/polysaccharides ; inclure la méthode d'extraction.
    Service Pore-C Cellules/noyaux selon le SOP (contactez-nous avant la fixation) — Chaîne du froid (4 °C) Consulter pour les montants d'entrée
    Service Iso-Seq TAIL ≥1 µg d'ARN total ; RIN ≥8 ARN A260/280 ~2,0 ; A260/230 ≥2,0 Glace carbonique Rapports TSS/TES et longueur de la queue poly(A) ; maintenir une haute intégrité de l'ARN.

    Notes générales

    • Évitez les inhibiteurs (phénol, héparine, EDTA, polysaccharides) et les cycles répétés de congélation–décongélation ; ne desséchez pas trop les billes.
    • Utilisez des pointes à large ouverture et évitez le vortexage pour l'ADN HMW.
    • Inclure une méthode d'extraction brève et tout contaminant connu.
    • Des matrices à faible apport/FFPE ou inhabituelles peuvent être réalisables—contactez-nous pour un protocole personnalisé.

    Flux de travail du projet

    Project workflow for Oxford Nanopore sequencing showing five steps with icons: Consultation & Design, Sample Prep & Shipping, Sequencing (ONT), Bioinformatics Analysis, and Delivery & Review.

    Étude de cas client (Recherche publiée)

    Titre: La méthylation médiée par FIONA1 de l'UTR 3' de FLC affecte FLC niveaux de transcription et floraison chez Arabidopsis (Cas d'utilisation d'Oxford Nanopore)

    • Auteurs : Bin Sun, Kaushal Kumar Bhati, Peizhe Song, et al.
    • Date de publication : 27 septembre 2022
    • Journal : PLOS Génétique

    Question de recherche (Attention)

    Quelle enzyme installe m^6A au niveau de l'UTR 3′ de l'ARNm du FLOWERING LOCUS C (FLC), et comment cette modification affecte-t-elle la stabilité du transcript FLC et la floraison ?

    Approche:

    Un design multi-omique a intégré le séquençage d'ARN direct Oxford Nanopore, le mRNA-seq et le meRIP-seq pour profiler l'expression différentielle et la méthylation différentielle de l'ARN chez des plantes de type sauvage par rapport aux mutants FIONA1 (FIO1). L'ARN direct a capturé les caractéristiques du signal natif tandis que le meRIP-seq a cartographié les régions enrichies en m^6A ; les preuves combinées ont localisé le site de modification dans l'UTR 3′ du FLC.

    Principales conclusions:

    • FIO1 est la méthyltransférase responsable de la m^6A en 3′UTR sur l'ARNm FLC.
    • La perte de cette méthylation à l'extrémité 3′ dans les mutants fio1 destabilise l'ARNm FLC (niveaux réduits de FLC) et contribue à un phénotype à floraison précoce.
    • Les auteurs ont publié des données RNA directes Nanopore (GEO : GSE212766) et des ensembles de données mRNA/meRIP correspondants, soutenant la reproductibilité.

    Direct RNA-sequencing analysis results.Analyse de séquençage RNA direct.

    Ce que cela démontre:

    Cette étude évaluée par des pairs montre comment le séquençage d'ARN direct par nanopore—associé à l'analyse des modifications de l'ARN (m^6A)—répond à des questions biologiques qui dépendent de l'ARN natif et de la régulation post-transcriptionnelle. C'est un excellent exemple de "technologie de séquençage par nanopore, bioinformatique et applications" pour l'épitrancriptomique et les mécanismes de régulation des gènes.

    Comment CD Genomics définirait l'étendue d'un projet similaire.:

    • ServiceSéquençage RNA direct par nanopore (+ meRIP-seq optionnel via le flux de travail partenaire)
    • Analyseprofilage des isoformes, résumés des signaux associés aux modifications, expression différentielle, intégration avec les pics m^6A basés sur l'immunoprécipitation
    • Livrables: FASTQ (ARN direct), POD5/FAST5 optionnel, rapport de QC, résumés des modifications, figures/tableaux adaptés à la publication

    FAQ — Séquençage Nanopore

    À des fins de recherche uniquement, non destiné à un diagnostic clinique, un traitement ou des évaluations de santé individuelles.
    Publications

    FIONA1-mediated methylation of the 3’UTR of FLC affects FLC transcript levels and flowering in Arabidopsis

    PLoS Genetics | 2022

    https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010386

    Lire plus de publications

    Ressources en vedette
    Solutions de séquençage par nanopores
    Catalogue

    Solutions de séquençage par nanopores

    Télécharger
    Séquençage longue lecture : PacBio SMRT vs. Oxford Nanopore
    Avis

    Séquençage longue lecture : PacBio SMRT vs. Oxford Nanopore

    Télécharger
    Services associés
    Séquençage par nanopores : principes, plateformes et avantages
    Séquençage par nanopores : principes, plateformes et avantages
    Séquençage de transcriptome complet : Une comparaison entre PacBio Iso-Seq et Nanopore Direct RNA-Seq
    Séquençage de transcriptome complet : Une comparaison entre PacBio Iso-Seq et Nanopore Direct RNA-Seq
    Demande de devis
    ! À des fins de recherche uniquement, non destiné à un diagnostic clinique, un traitement ou des évaluations de santé individuelles.
    Contactez CD Genomics
    Services
    À propos de nous
    Contactez-nous
    Soumettez votre demande
    Conditions Générales | Politique de confidentialité | Retour d'information   Droit d'auteur © CD Genomics. Tous droits réservés.
    Haut