CD Genomics insiste sur l'offre de services de séquençage de nouvelle génération (NGS) de haute qualité aux chercheurs du monde entier.
Qu'est-ce que le NGS ?
NGS, également connu sous le nom de séquençage à haut débit, est une technologie de séquençage de l'ADN qui a révolutionné la recherche génomique et moléculaire et a influencé tous les domaines de la recherche biologique. Elle est devenue de plus en plus répandue dans la société moderne. Le NGS nous permet de séquencer l'ADN et l'ARN de manière beaucoup plus précise, rapide et économique.
Séquençage de bibliothèque est une technique qui englobe l'étape initiale d'attachement d'adaptateurs, qui incluent des éléments tels que des séquences d'index, des codes-barres et des régions de liaison de primers de séquençage, aux deux extrémités des fragments cibles souhaités. Par la suite, ces fragments préparés sont soumis à un séquençage à l'aide d'un séquenceur dédié. En revanche, séquençage ciblé se caractérise par la capture sélective de gènes ou de régions d'intérêt particuliers avant la phase de séquençage. Notamment, les principales méthodes pour réaliser le séquençage ciblé comprennent la capture hybride et la PCR multiplex.
Services NGS chez CD Genomics
Avec nos nombreuses années d'expérience, CD Genomics est un fournisseur de services NGS de premier plan pour offrir un séquençage avancé et solutions en bioinformatique pour ses clients du monde entier. Équipé d'un large éventail de technologies de pointe et soutenu par une équipe de professionnels expérimentés, CD Genomics s'engage à offrir un service complet incluant la conception expérimentale, l'isolement de l'ADN, la fragmentation de l'ADN, la préparation de bibliothèques, le séquençage et la bioinformatique. En conséquence, nous fournissons des résultats rapides, rentables et de haute qualité qui permettent aux chercheurs d'atteindre des percées scientifiques.
Nous proposons les deux plateformes de séquençage Illumina, PacBio Séquençage à Molécule Unique en Temps Réel (SMRT) et Technologies de nanopores pour répondre à un large éventail d'objectifs de recherche et à votre budget.
Nos technologies et produits ont été validés grâce à de multiples partenariats avec des instituts académiques, des entreprises de diagnostic et des laboratoires d'essai.
Nos solutions NGS comprennent :
Le séquençage du génome est la méthodologie utilisée pour appliquer des techniques de séquençage de l'ADN à haut débit, ainsi que des outils de bioinformatique avancés, pour la compilation et l'examen des constituants fonctionnels et structurels d'un génome entier. Cette approche complète facilite l'examen des disparités et distinctions individuelles au sein des populations. De plus, en exécutant séquençage de novo et en utilisant des méthodologies de bioinformatique, il devient possible de dériver des cartes génétiques pour diverses espèces.
Le terme "transcriptome" englobe l'ensemble des transcrits générés par les cellules ou les tissus d'une espèce particulière dans des conditions spécifiques. En s'appuyant sur le séquençage à haut débit de deuxième génération, il devient possible d'acquérir de manière efficace et extensive des données de séquence concernant presque tous les transcrits et des informations sur l'expression génique différentielle au sein des tissus ou des organes d'une espèce spécifique dans des conditions particulières. Cette approche a trouvé une large utilité dans divers domaines, englobant la recherche fondamentale, le diagnostic clinique et la recherche et développement pharmaceutiques.
L'épigénétique, souvent appelée épigénomique, épitranscriptomique ou post-génétique, englobe l'étude des modifications durables de l'expression génique ou des caractéristiques cellulaires qui se manifestent par des mécanismes spécifiques, sans modifier la séquence de l'ADN. Ce domaine de recherche trouve des applications dans les domaines de la biologie et des disciplines génétiques spécialisées.
Le séquençage du microbiome englobe le processus d'amplification des segments remarquablement variables des micro-organismes. 16S rADN, 18S rADN et ITS, succédé par le séquençage à haut débit. Cette méthodologie facilite l'examen de la composition des espèces et des variations d'abondance relative parmi les bactéries, les archées, les champignons et d'autres microorganismes présents dans un environnement donné. Elle offre des informations précieuses sur la composition structurelle des communautés microbiennes, les liens évolutifs, ainsi que les interrelations entre les microorganismes et leur environnement dans des échantillons environnementaux.
Séquençage métagénomique, à l'inverse, implique l'examen de la constitution génomique des communautés microbiennes au sein d'environnements distincts, en utilisant des techniques de séquençage à haut débit. Cette approche facilite l'exploration de la diversité microbienne, des dynamiques de population, de la fonctionnalité des gènes, des réseaux métaboliques et des connexions évolutives. De plus, elle permet d'étudier les activités fonctionnelles au sein des communautés microbiennes, les interactions entre divers micro-organismes et leurs interrelations avec l'environnement environnant. La recherche en séquençage métagénomique surmonte les défis associés à la culture et à l'isolement des micro-organismes, élargissant le champ d'utilisation des ressources microbiennes et offrant un instrument efficace pour l'examen des communautés microbiennes environnementales.
Le séquenceur PacBio Sequel est la dernière plateforme de séquençage de troisième génération de Pacific BioSciences, utilisant la technologie de séquençage en temps réel à molécule unique (SMRT). Il offre une longueur de lecture moyenne allant jusqu'à 15 kilobases (Kb), avec des lectures les plus longues atteignant 40-60 Kb. Le système de séquençage comprend 16 modules de séquençage de cellules SMRT, chacun capable de produire 5-10 gigabases (Gb) de données. Notamment, la technologie SMRT permet le séquençage de molécules d'ADN individuelles sans besoin d'amplification, atténuant efficacement le biais GC induit par la PCR et garantissant une couverture de séquence complète et uniforme. Actuellement, la technologie de séquençage SMRT de PacBio trouve des applications répandues dans l'assemblage de génomes complexes et transcriptome complet séquençage des organismes eucaryotes.
Le séquençage par nanopore, comme son nom l'indique, repose fondamentalement sur l'utilisation d'un nanopore—un petit pore avec des adaptateurs moléculaires attachés de manière covalente. La protéine nanopore est solidement fixée à une membrane, avec une protéine dynamique qui fait passer des acides nucléiques à travers le nanopore. Lorsqu'un acide nucléique traverse le nanopore, il induit des changements de charge, provoquant ainsi des fluctuations du courant sur la membrane. En raison du diamètre extrêmement étroit des nanopores, seuls des polymères d'acides nucléiques individuels peuvent passer. Comme les propriétés de charge électrique des bases individuelles ATCG diffèrent, l'interférence qu'elles génèrent dans le courant lorsqu'elles passent à travers la protéine nanopore varie. En surveillant et en décodant en continu ces signaux de courant, il est possible de déterminer la séquence des bases, permettant ainsi le séquençage.
CD Genomics utilise la plateforme Nanopore pour réaliser des milliers de projets de séquençage de génomes bactériens et de métagénomes, y compris l'analyse des données. Nous effectuons également des milliers de séquençages de transcriptomes complets et de RNA Direct, ainsi que l'analyse des données qui en découle.
Avantages de nos services NGS :
Personnel hautement expérimenté et qualifié
Instruments de pointe et technologies de pointe
Contrôle qualité rigoureux
Solutions NGS personnalisées et bioinformatique sur mesure pour répondre à vos besoins de recherche.
Conception de stratégie professionnelle
Large éventail d'applications
Prix compétitif
Naviguez pour découvrir comment nous pouvons vous aider à atteindre vos objectifs de recherche grâce aux technologies NGS. Pour plus d'informations, veuillez nous contacter ! Nos spécialistes de niveau doctorat, leaders de l'industrie, sont toujours dédiés à fournir un soutien complet et à résoudre les problèmes techniques le plus rapidement possible.
À des fins de recherche uniquement, non destiné à un diagnostic clinique, un traitement ou des évaluations de santé individuelles.
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