Introduction
L'ère de la génomique a été marquée par des avancées remarquables dans les technologies de séquençage, permettant aux chercheurs d'explorer plus en profondeur les complexités du génome. Une telle avancée est l'émergence du séquençage à longues lectures, qui offre des avantages sans précédent pour capturer les variations structurelles, le splicing alternatif et l'expression des isoformes de gènes. CD Genomics, une entreprise leader dans le domaine de la génomique, présente fièrement son service d'analyse de données de séquençage à longues lectures (LRS) de pointe.
Analyse bioinformatique des données de séquençage à lecture longue
Le séquençage à lecture longue (séquençage par nanopore et séquençage en temps réel à molécule unique (SMRT)) génère des lectures de séquençage étendues, révolutionnant notre capacité à explorer le paysage complexe du génome. Cependant, l'analyse de ces ensembles de données volumineux pose des défis uniques. CD Genomics, avec son expertise approfondie en analyse bioinformatique, utilise des outils et des pipelines informatiques de pointe pour surmonter ces défis et extraire des informations précieuses des données de séquençage à lecture longue.
Aperçu des outils et pipelines d'analyse des longues lectures.
Contrôle de la qualité et correction des erreurs
Des données de haute qualité sont essentielles pour une analyse en aval précise. CD Genomics applique des mesures de contrôle de qualité rigoureuses pour évaluer l'intégrité des données de séquençage à longue lecture. Grâce à un nettoyage et un filtrage minutieux de la qualité, nous garantissons l'élimination des artefacts et des lectures de faible qualité, améliorant ainsi la fiabilité des analyses ultérieures.
Expression des gènes/isoformes de gènes
Le séquençage à long terme permet une analyse complète de l'expression génique et de la diversité des isoformes. CD Genomics utilise des algorithmes et des outils sophistiqués pour quantifier avec précision les niveaux d'expression des gènes et des isoformes. Cela facilite l'identification des gènes et des isoformes différemment exprimés dans diverses conditions, éclairant ainsi des processus biologiques cruciaux et des mécanismes régulateurs.
Découverte de nouveaux gènes et identification des isoformes complètes
La découverte de nouveaux gènes et d'isoformes complètes est essentielle pour élargir notre compréhension du génome. CD Genomics utilise des méthodes avancées d'assemblage du transcriptome pour reconstruire des structures géniques complètes et identifier de nouveaux gènes et isoformes avec une grande précision. En tirant parti de la puissance du séquençage à longues lectures, notre service facilite la découverte de gènes et de variantes de transcrits auparavant non annotés.
Détection de gènes de fusion de novo et profils d'expression des isoformes de fusion
Les gènes de fusion, formés par des réarrangements génomiques, jouent un rôle crucial dans le cancer et d'autres maladies. CD Genomics utilise des algorithmes et des pipelines spécialisés pour détecter les gènes de fusion et déterminer leurs profils d'expression. Grâce à une analyse approfondie des isoformes de fusion, notre service aide à déchiffrer les mécanismes sous-jacents au développement et à la progression des maladies.
Expression spécifique à l'allèle et haplotypage
Comprendre l'expression spécifique des allèles et les haplotypes est essentiel pour déchiffrer les complexités des variations génétiques. CD Genomics propose une analyse précise des données de séquençage à long terme pour élucider les motifs d'expression spécifique des allèles et les haplotypes. Ces informations offrent des perspectives sur la régulation de l'expression génique et l'impact des variations génétiques sur les traits phénotypiques.
Assemblage de génome de novo
L'assemblage de génomes de novo est une étape cruciale pour déchiffrer des génomes complexes, en particulier chez les organismes non modèles. CD Genomics utilise des algorithmes d'assemblage de pointe optimisés pour les données de séquençage à long terme afin de reconstruire des assemblages de génomes de haute qualité. Cela permet d'identifier des variations structurelles, des annotations géniques et des analyses à l'échelle du génome avec une précision exceptionnelle.
Assemblage de transcriptome de novo
CD Genomics propose des services complets d'assemblage de transcriptome de novo en utilisant des données de séquençage à long brin. En s'appuyant sur des algorithmes avancés, nous reconstruisons des isoformes de transcrits de pleine longueur, découvrons des événements d'épissage alternatif et fournissons des annotations génétiques précises. Cela permet aux chercheurs d'obtenir des informations plus approfondies sur le paysage transcriptomique et de déchiffrer les complexités de la régulation génique.
Appel à la méthylation, positionnement des nucléosomes et accessibilité de la chromatine
Les modifications épigénétiques jouent un rôle essentiel dans la régulation des gènes et le développement des maladies. CD Genomics propose une analyse complète des données de séquençage à longue lecture pour identifier les motifs de méthylation de l'ADN, déterminer le positionnement des nucléosomes et l'accessibilité de la chromatine. En analysant les données de séquençage à longue lecture, CD Genomics peut cartographier avec précision les positions des nucléosomes et évaluer l'accessibilité de la chromatine à travers le génome. Ces informations fournissent des aperçus précieux sur la régulation des gènes, la structure de la chromatine et l'impact des modifications épigénétiques sur les processus cellulaires.
Avantages du service d'analyse des données de séquençage à long terme de CD Genomics
Précision et exactitude sans égal : Notre équipe expérimentée garantit les normes les plus élevées en matière d'analyse de données, fournissant des résultats précis et exacts.
Solutions d'analyse de données personnalisées : Nous adaptons nos pipelines d'analyse pour répondre à vos objectifs de recherche spécifiques, en fournissant des solutions sur mesure pour les exigences uniques de votre projet.
Pipelines de bioinformatique à la pointe de la technologie : Nous utilisons des pipelines de bioinformatique à la pointe, optimisés pour l'analyse des données de séquençage à long terme, intégrant les derniers algorithmes et outils.
Rapports d'analyse complets et interprétation : Notre service comprend des rapports d'analyse détaillés et des interprétations claires des résultats, vous permettant de tirer des enseignements significatifs des données.
Délai d'exécution efficace : Nous privilégions des résultats rapides sans compromettre la qualité, garantissant que vous receviez vos résultats d'analyse dans les délais convenus.
Confidentialité et sécurité des données : Nous maintenons des protocoles de gestion des données stricts et mettons en œuvre des mesures de sécurité robustes pour garantir la confidentialité et l'intégrité de vos données de séquençage.
En choisissant le service d'analyse de données de séquençage à long brin de CD Genomics, vous accédez à une analyse précise et personnalisée, à des pipelines bioinformatiques de pointe, à des rapports complets, à des délais de traitement efficaces et à la sécurité des données, vous permettant d'avancer dans vos recherches génomiques en toute confiance.
À des fins de recherche uniquement, non destiné à un diagnostic clinique, un traitement ou des évaluations de santé individuelles.
Directives de Soumission d'Échantillons
