N nouvel Atlas des T-Cellules Pan-Cancer Révèle de Nouvelles Façons pour les T-Cellules Tumorales d'Infiltration de 'Faire Grève'

Les lymphocytes T infiltrant les tumeurs (TIL) sont un composant important du microenvironnement immunitaire tumoral (TIME) et montrent une efficacité anticancéreuse, comme les thérapies par cellules T à récepteur antigénique chimérique (CAR), les thérapies par TIL et les thérapies par blocage des points de contrôle immunitaire (ICB), offrant une voie prometteuse pour le traitement du cancer. Les TIL sont extrêmement diversifiés en termes de phénotype et de fonction, et leurs caractéristiques phénotypiques dans le microenvironnement immunitaire et leur composition cellulaire déterminent l'efficacité et les effets secondaires potentiels des thérapies anticancéreuses. Étant donné l'hétérogénéité remarquable des TIL et l'expansion rapide des thérapies actuelles basées sur les cellules T ou des thérapies combinées dans différents types de cancer, une analyse complète et approfondie des TIL est justifiée.

Un atlas unicellulaire des cellules T

Récemment, un article intitulé "L'atlas des cellules T pan-cancer relie un état de réponse au stress cellulaire à la résistance à l'immunothérapie" a été publié dans Médecine de la NatureL'étude a construit un atlas unicellulaire des cellules T basé sur transcriptomique des données provenant de 308 048 cellules T infiltrant les tumeurs de 16 types de cancer, révélant des sous-ensembles hétérogènes de états des cellules T jusqu'alors non décrits, des cellules T auxiliaires folliculaires, des cellules T régulatrices et prolifératives, et identifiant un état de réponse au stress unique, TSTR, caractérisé par l'expression de gènes de choc thermique.

L'équipe a analysé des cellules T provenant de 27 ensembles de données de séquençage d'ARN à cellule unique, y compris neuf ensembles de données uniques de MD Anderson, couvrant un total de 16 types de cancer. L'équipe a cartographié le nouvel atlas pan-cancer des cellules T, qui est la caractérisation la plus détaillée de l'hétérogénéité des cellules T présente dans le microenvironnement tumoral à ce jour. Le nouvel atlas pan-cancer des cellules T identifie un total de 32 sous-populations distinctes de cellules T, révélant comment les états phénotypiques des cellules T et les proportions relatives de chacune jouent un rôle clé dans la détermination de l'efficacité de l'immunothérapie et des effets indésirables potentiels.

Analyse pan-cancer des cellules T. (Chu et al., 2023)

L'étude a identifié un état de réponse au stress des cellules T (TSTR) précédemment non décrit, révélant une nouvelle façon pour les cellules T infiltrant les tumeurs de "faire grève". Dans des études antérieures sur des cellules uniques, ces cellules T étaient souvent négligées ou considérées comme des artefacts associés aux processus d'isolement des tissus. Cependant, sur la base de la grande quantité de données disponibles, les chercheurs ont maintenant identifié les cellules TSTR comme une population distincte, clairement différenciée des autres sous-ensembles de cellules T CD4 ou CD8, et leur présence a été détectée in situ par plusieurs méthodes d'analyse spatiale dans le microenvironnement tumoral (TIME) de différents types de cancer.

L'équipe de recherche a analysé 375 patients issus de 23 cohortes, dont 171 ont été traités par des inhibiteurs de points de contrôle immunitaire, afin d'évaluer l'état des cellules T. Les résultats ont montré que l'état/la composition des cellules T corrélait avec les caractéristiques génomiques, pathologiques et cliniques de tous les patients. Notamment, la proportion de cellules TSTR parmi les cellules T CD4 et CD8 et l'expression des gènes de choc thermique étaient significativement augmentées et régulées à la hausse après le traitement par inhibiteurs de points de contrôle immunitaire, en particulier chez les patients non répondeurs. Ces résultats suggèrent que les cellules TSTR pourraient jouer un rôle dans la résistance à l'immunothérapie. Dans l'ensemble, ce nouvel état des cellules T approfondit la compréhension de la biologie complexe du cancer et fournit une cible potentielle pour de futures thérapies.

Fractionnement des cellules T et différenciation cellulaire. (Chu et al., 2023)

L'étude fournit un atlas des cellules T haute résolution avec des états cellulaires bien définis et des signatures génétiques. Au total, l'équipe a caractérisé 32 états des cellules T et a identifié sept sous-populations dans la sous-population régulatrice CD4, cinq sous-populations dans la population des cellules T auxiliaires folliculaires CD4, et huit états dans les cellules T proliférantes. Ces résultats soulignent la grande hétérogénéité des états des cellules T dans le microenvironnement tumoral et la nécessité de mieux comprendre comment ces états contribuent à la progression de la maladie et à la réponse immunothérapeutique. Les résultats de cette étude pourraient aider les chercheurs à réaliser une analyse approfondie des cellules T et à faciliter le développement de stratégies pouvant améliorer la thérapie par cellules T.

Référence:

1. Chu, Yanshuo, et al. "L'atlas des cellules T pan-cancer relie un état de réponse au stress cellulaire à la résistance à l'immunothérapie." Médecine de la Nature (2023) : 1-13.