Service de microarray LncRNA

CD Genomics propose un service complet de profilage par microarray de LncRNA (ARN non codant long), utilisant certaines des plateformes les plus avancées disponibles dans le domaine. Nos méthodologies garantissent une précision et une sensibilité inégalées. Grâce à des procédures de contrôle qualité rigoureuses et par étapes, nous nous engageons à fournir des résultats hautement fiables et reproductibles.

Introduction aux microarrays de LncRNA

Les lncARN sont une classe diversifiée et étendue de molécules d'ARN transcrites, chacune mesurant plus de 200 nucléotides de long, qui n'encode pas de protéines. Leur expression est régulée de manière complexe durant le développement et peut être très spécifique à certains tissus ou types cellulaires. Une fraction notable des lncARN réside exclusivement dans le noyau.

Ces molécules sont considérées comme jouant des rôles régulateurs significatifs, ajoutant de nouvelles couches de complexité à notre compréhension de la régulation génomique. La spécificité et les fonctions régulatrices des lncARN mettent en évidence leur importance dans le réseau complexe de l'expression génique.

La technologie des microarrays de lncRNA se distingue comme un outil sophistiqué pour analyser l'expression des lncRNA dans divers scénarios biologiques. Contrairement à Séquençage de l'ARN, qui peuvent faiblir avec des lncARNs de faible abondance, les microarrays excellent dans le profilage à haut débit. Ces puces sont conçues pour détecter des milliers de lncARNs ainsi que des ARNm codant des protéines dans une seule expérience. En utilisant des conceptions de sondes avancées et des bases de données lncARN étendues, les microarrays permettent une évaluation approfondie des dynamiques d'expression des lncARNs.

CD Genomics propose un service de microarray lncRNA de premier plan qui allie technologie de pointe et contrôle qualité rigoureux. Le service englobe chaque étape, de la préparation des échantillons et de l'hybridation des microarrays à une analyse de données approfondie, garantissant que les résultats sont à la fois de haute qualité et fiables.

Avantages et caractéristiques des microarrays de LncRNA

• Sensibilité et précision exceptionnelles: Microarrays détecter des lncRNAs à faible abondance avec une grande précision, surpassant l'ARN-seq dans la quantification de ces expressions subtiles.
• Couverture de données étendueCD Genomics utilise des bases de données complètes et à jour comme GENCODE et RefSeq, garantissant une large couverture actuelle des lncRNA.
• Annotation et analyse approfondiesLe service comprend une annotation et une analyse détaillées, couvrant le contexte génomique et la localisation subcellulaire pour élucider les fonctions des lncRNA.
• Solutions sur mesureCD Genomics propose des solutions de microarray personnalisables pour répondre à des besoins de recherche spécifiques, offrant des options flexibles et personnalisées.
• Obtenez des données de haute qualité rapidement et sans tracas.
• Un rapport final unique avec une analyse de données de base gratuite.
• Données et rapports livrés par des moyens sécurisés.

Applications des microarrays de LncRNA

• Profilage global des longs transcrits
• Recherche sur le cancer
• Maladies cardiovasculaires
• Troubles neurologiques

Flux de travail du service de microarray LncRNA

Spécifications de service

	Exigences d'échantillon Espèces : humain, souris, rat Échantillons d'ARN et tissus ou spécimens cellulaires bien préservés ARN≥200 ng Remarque : Les montants d'échantillons sont indiqués à titre de référence uniquement. Pour des informations détaillées, veuillez contactez-nous avec vos demandes personnalisées.
Cliquez	Stratégie de séquençage vous pouvez vous référer aux recommandations et au service personnalisé suivants.
	Analyse bioinformatique Nous proposons plusieurs analyses bioinformatiques personnalisées, y compris, mais sans s'y limiter : Analyse GO Analyse des voies Analyse différentielle de l'expression des lncrna Analyse de l'expression génique différentielle Remarque : Les sorties de données et les contenus d'analyse recommandés affichés sont à titre de référence uniquement. Pour des informations détaillées, veuillez contactez-nous avec vos demandes personnalisées.

Recommandations et service personnalisé

Tableau 1 Microarrays d'expression des LncRNA Agilent

Pipeline d'analyse

Livrables

• Les données brutes
• Résultats expérimentaux
• Rapport d'analyse des données
• Détails dans le microarray LncRNA pour votre rédaction (personnalisation)

CD Genomics peut également vous aider à créer votre microarray LncRNA personnalisé. Nous sommes prêts à vous aider avec vos besoins en matière de microarray, que ce soit un design standard ou quelque chose de plus créatif.

Donc, ce que vous devez faire est simplement de nous envoyer vos échantillons, nous pouvons vous fournir le rapport final qualifié. Pour plus de détails, n'hésitez pas à nous contacter à tout moment pour toute question en remplissant un formulaire sans engagement. demande de devis.

Les résultats partiels sont montrés ci-dessous :

1. Quels défis sont associés à la détection des lncARN par rapport aux ARN messagers ?

La détection des ARN non codants longs (lncARN) présente des défis distincts par rapport aux ARN messagers (ARNm), principalement en raison de leurs niveaux d'expression intrinsèquement plus faibles et de leur spécificité tissulaire prononcée. Les attributs uniques des lncARN, tels que leur faible abondance et leur grande diversité d'isoformes, introduisent une complexité supplémentaire dans leur analyse. Pour surmonter efficacement ces obstacles, notre microarrays ont été méticuleusement conçus pour garantir la détection et la quantification précises des lncARN, malgré leur nature complexe.

2. Comment la sensibilité des microarrays de lncRNA se compare-t-elle à Séquençage de l'ARN?

En termes de sensibilité, les microarrays de lncRNA présentent des performances supérieures pour détecter les lncRNA à faible abondance par rapport au séquençage de l'ARN. Le séquençage de l'ARN peut rencontrer des problèmes de précision, notamment en raison de taux d'erreur élevés et des niveaux d'expression intrinsèquement faibles de ces transcrits. En revanche, nos microarrays offrent des mesures fiables avec une susceptibilité minimale aux variations causées par la faible abondance des transcrits, améliorant ainsi la sensibilité globale de détection.

3. Les microarrays d'lncRNA peuvent-ils détecter différents isoformes de transcrits ?

Absolument, nos microarrays d'lncRNA sont capables de différencier et de détecter diverses isoformes. Contrairement aux ARNm, les lncRNAs sont connus pour générer plusieurs isoformes, chacune ayant des rôles biologiques distincts. Notre conception avancée de microarray garantit l'identification et la quantification précises de ces isoformes diverses, offrant ainsi une compréhension complète de la fonctionnalité des lncRNA.

4. Comment la précision de la quantification des lncRNA dans les microarrays se compare-t-elle aux méthodes de séquençage ?

En ce qui concerne la quantification des lncRNAs de faible abondance, la technologie des microarrays offre une plus grande précision par rapport aux méthodes de séquençage, qui sont souvent entravées par des taux d'erreur plus élevés et des limitations de couverture. Nos microarrays sont rigoureusement conçus pour atténuer ces problèmes, ce qui permet de fournir des données plus fiables et plus complètes, améliorant ainsi considérablement la précision de la quantification des lncRNAs.

5. Quelles solutions personnalisées sont disponibles pour l'analyse des microarrays lncRNA ?

Nous proposons des solutions de microarrays lncRNA sur mesure qui répondent à des besoins de recherche spécifiques. Que vos exigences concernent des arrays standards ou des designs innovants, nos options personnalisables garantissent que nos services sont précisément alignés avec vos objectifs de recherche. Cette flexibilité facilite l'acquisition d'informations génomiques ciblées et complètes, faisant ainsi progresser vos efforts scientifiques.

Analyse intégrée des profils d'expression des lncRNA et des mRNA indiquant des changements liés à l'âge dans le ménisque.

Journal : Frontières en biologie cellulaire et du développement
Facteur d'impact : 5,206
Publié : 10 mars 2022

Contexte

Le ménisque, crucial pour la fonction du genou, se détériore avec l'âge, augmentant le risque d'arthrose en raison de changements tels que l'épaississement du collagène. Les ARN longs non codants (lncARN) jouent un rôle important dans le vieillissement des tissus et peuvent contribuer à la dégénérescence du ménisque. Pour explorer cela, l'étude a analysé les profils d'expression des lncARN et des ARN messagers (ARNm) dans les ménisques jeunes et vieillissants en utilisant microarray analyse, suivie de la bioinformatique pour identifier les molécules et les voies clés impliquées dans les changements du ménisque liés à l'âge.

Matériaux et Méthodes

Résultats

L'étude a utilisé le microarray Arraystar Human lncRNA et mRNA pour comparer les tissus du ménisque des groupes jeunes et âgés (n = 4/groupe). Elle a identifié 1608 lncRNAs exprimés de manière différentielle et 1809 mRNAs exprimés de manière différentielle. Les motifs d'expression ont été visualisés à l'aide de diagrammes en volcan et de regroupement hiérarchique.

FIGURE 1. Identification des lncRNAs et mRNAs DE.

Les analyses GO et des voies de signalisation de 1809 ARNm différentiellement exprimés ont mis en évidence des voies clés impliquées dans les dommages au cartilage, y compris TGF-bêta, Wnt et PI3K-Akt. L'étude a identifié 18 ARNm significativement modifiés, avec une régulation à la baisse notable de FGF6 et PPP2R5C.

FIGURE 2. Analyse d'enrichissement fonctionnel des ARNm DE.

Une analyse du réseau ceRNA utilisant 19 ARNm DE et 46 lncARNs DE a identifié 98 nœuds et 229 arêtes. Le réseau, construit avec Cytoscape, a mis en évidence le lncRNA POC1B-AS1, qui a été examiné plus en détail pour ses interactions avec les miARN et ses gènes cibles dans un sous-réseau détaillé.

FIGURE 3. Analyse CeRNA.

Conclusion

Cette étude a révélé des changements significatifs dans l'expression des lncRNA et des mRNA dans le ménisque vieillissant, y compris une diminution des niveaux de MMP-2 et de COL1A2. Des voies clés comme Hippo et TGF-bêta sont impliquées dans la dégénérescence méniscale. Des expressions anormales de lncRNA suggèrent de nouvelles cibles thérapeutiques pour traiter la dégénérescence méniscale.

Référence

1. Ai LY, Du MZ, Chen YR, et al. Analyse intégrée des profils d'expression des lncRNA et des mRNA indiquant des changements liés à l'âge dans le ménisque. Frontières en biologie cellulaire et développementale. 2022, 10:844555.