LncRNA utilisé pour révéler les mécanismes du cancer et fournir des stratégies de traitement.

Ces dernières années, les ARN non codants de longue chaîne (LncRNA) sont devenus un sujet de recherche majeur dans le domaine scientifique et de nombreuses études ont révélé les rôles multifacettes des ARN non codants longs (lncRNAs) dans la régulation génique, accompagnés d'une compréhension accrue du traitement, de la localisation, des macromolécules interactives et des modules structurels des lncRNA. Des preuves émergentes ont récemment suggéré le rôle crucial des ARN non codants longs (lncRNAs) dans la tumorigenèse et la progression. Divers lncRNAs ont montré une expression aberrante et participent à des phénotypes cancéreux par leur liaison avec l'ADN, l'ARN ou des protéines, ou en codant de petits peptides.

Exploration du mécanisme moléculaire de la métastase du cancer colorectal à travers les LncRNA

L'ARN non codant long (lncRNA) est un nouveau régulateur majeur de l'invasion cellulaire et de la métastase, et les ARN non codants longs (lncRNAs) sont un nouveau régulateur maître de l'invasion cellulaire et de la métastase. Le taux de survie des patients atteints de métastases hépatiques provenant d'un cancer colorectal reste très faible. Le nombre de régulateurs de CRLM et d'indicateurs cliniques reste limité. Cependant, le nombre de facteurs régulateurs de CRLM et d'indicateurs cliniques est encore limité. CRLM1 était faiblement associé aux régions chromatiniennes des gènes impliqués dans l'adhésion cellulaire et les dommages à l'ADN, et cette association était corrélée de manière bidirectionnelle avec l'expression des gènes pro-métastatiques régulés par CRLM1. Cette recherche a étudié la dynamique d'expression de l'lncRNA dans le CRLM, le CRC primaire et les tissus normaux, et a découvert une série de lncRNAs liés à la métastase, y compris CRLM1. CRLM1 inhibe l'apoptose des cellules CRC de souris nude Balb/C et favorise la métastase hépatique. CRLM1 est faiblement lié à la région chromatinienne des gènes impliqués dans l'adhésion cellulaire et les dommages à l'ADN, et cette association est bidirectionnelle par rapport à l'expression des gènes transférés régulés par CRLM1. CRLM1 interagit physiquement avec la protéine hnRNPK et favorise sa localisation nucléaire. CRLM1 a efficacement augmenté le taux d'occupation du promoteur de hnRNPK et co-régulé l'expression d'un groupe de gènes transférés. Cette étude a exploré le mécanisme moléculaire de CRLM1 à travers le séquençage d'ARN (RNA seq), la séparation de chromatine purifiée par ARN (ChiRP), l'immunofluorescence (IF) et d'autres méthodes. Les résultats ont montré qu'il existait des ARN non codants longs liés à CRLM. CRLM1, l'un de ces lncRNAs, non seulement prédit un mauvais pronostic, mais inhibe également l'apoptose et favorise la métastase in vivo et in vitro. Ces résultats nous aident à comprendre comment l'lncRNA régule la transcription par trans-régulation et à identifier des marqueurs pronostiques et des cibles thérapeutiques pour le CRLM.

Surexpression de CRLM1 dans les métastases hépatiques colorectales et associée à un faible taux de survie.

CRLM1-OE convertit le transcriptome des cellules CRC en état métastatique.

Comprendre les effets biologiques et les mécanismes fonctionnels des lncRNA favorise la progression du cancer du foie.

Le carcinome hépatocellulaire (CHC) est l'une des malignités les plus courantes dans le monde et se classe comme la troisième cause de décès liés au cancer. Des chercheurs ont réalisé un séquençage d'ARN sur des tissus de cancer du foie cliniques et des tissus hépatiques normaux adjacents pour identifier des lncARNs exprimés de manière différentielle. En croisant les cohortes WCH et TCGA, 101 lncARNs significativement altérés ont été identifiés. Par la suite, sur la base de l'analyse de survie de la cohorte TCGA LIHC, 5 lncARNs candidats ont été identifiés avec succès. Ensuite, les niveaux d'expression de ces lncARNs candidats ont été vérifiés par qRT PCR sur 20 paires d'échantillons de tissus, et TLNC1 a été identifié comme un lncARN tumorigène potentiel du cancer du foie. TLNC1 a significativement amélioré la croissance et la métastase des cellules d'hépatome à la fois in vitro et in vivo. En résumé, cette étude indique que TLNC1 peut promouvoir la croissance tumorale et la métastase du cancer du foie in vitro et in vivo. En termes de mécanisme, nous avons démontré que TLNC1 peut interagir avec TPR, renforcer l'interaction entre TPR et CRM1, et promouvoir la sortie nucléaire de p53, conduisant à la régulation à la baisse d'une série de suppresseurs de tumeurs et à la régulation à la hausse de nombreux oncogènes, contribuant finalement à l'induction de la croissance et de la métastase du cancer du foie. De plus, TLNC1 est un facteur pronostique prometteur du cancer du foie, et l'axe TLNC1-TPR-p53 peut servir de cible thérapeutique potentielle pour le traitement de l'hépatome.

TLNC1 est surexprimé dans les tissus du cancer du foie.

TLNC1 interagit avec TPR et réprime l'activité transcriptionnelle de p53.

L'lncRNA devient progressivement l'un des sujets brûlants de la biologie de l'ARN et de la recherche en oncologie. Comprendre comment les interactions entre l'lncRNA et les macromolécules se produisent est essentiel pour disséquer leurs mécanismes régulateurs. Sans aucun doute, les multiples facettes de la régulation génique médiée par l'lncRNA ont ajouté une nouvelle dimension au dogme central de la régulation génique. Cependant, des défis demeurent à plusieurs niveaux pour disséquer pleinement leurs fonctions. La caractérisation des lncRNAs et de leurs isoformes de manière spatio-temporelle dans des contextes normaux, de développement et de maladie doit être mieux développée. La combinaison de nouveaux outils pour résoudre la transcriptomique dynamique associée à un séquençage à longues lectures aidera à discriminer ces motifs spatio-temporels des différentes isoformes d'ARN in situ. En plus du profilage transcriptomique et unicellulaire dans différents contextes, il sera d'un grand intérêt de comprendre le traitement et le renouvellement des lncRNAs dans des cellules uniques, et d'apprendre leurs motifs de localisation au niveau des sous-organelles ainsi que les protéines interagissantes.

Références:

1. Chen, Ling-Ling. "Vers une compréhension in vivo et à plus haute résolution de la biogenèse et de la fonction des lncRNA." Méthodes de la nature vol. 19,10 (2022).
2. Wang, Zhe et al. "LncRNA CRLM1 inhibe l'apoptose et favorise la métastase par régulation transcriptionnelle en coopération avec hnRNPK dans le cancer colorectal." Cellules et biosciences vol. 12,1 120. 30 juil. 2022.
3. Huang, Zhao et al. "Le rôle des ARN non codants longs dans le carcinome hépatocellulaire." Cancer moléculaire vol. 19,1 77. 15 avr. 2020.
4. Yuan, Kefei et al. "Le long ARN non codant TLNC1 favorise la croissance et la métastase du cancer du foie en inhibant la signalisation p53." Cancer moléculaire vol. 21,1 105. 27 avr. 2022.