GWAS identifie le locus FOXP4 comme un acteur clé dans le Long COVID.

Le COVID long, selon la définition de l'Organisation mondiale de la santé, fait référence aux individus qui restent symptomatiques pendant au moins 2 mois après une nouvelle infection par le coronavirus, survenant 3 mois après l'infection initiale, et qui ne peuvent pas être attribués à d'autres conditions sous-jacentes. La prévalence de cette condition a été largement étudiée, avec des estimations variant de 10 % à 70 %, affichant une hétérogénéité significative dans sa manifestation, une cause inconnue, une pathogénèse diverse et des symptômes qui évoluent avec le temps.

Récemment, l'Institut Karolinska à Stockholm a réalisé une étude révolutionnaire. étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) axé sur le long COVID en utilisant les données de HGI. Cette vaste étude a analysé des informations provenant de 24 projets de recherche menés dans 16 pays différents, impliquant 6 450 patients diagnostiqués avec un long COVID et 1 093 995 sujets témoins. À la suite de cette étude, ils ont identifié la première association significative à l'échelle du génome liée au long COVID au locus FOXP4. Notamment, il a été constaté que FOXP4 était associé non seulement à la gravité de la nouvelle pneumonie à couronne, mais aussi à la fonction pulmonaire et au cancer, ce qui implique que la dysfonction pulmonaire et la gravité de la nouvelle pneumonie à couronne jouent des rôles plus larges dans la physiopathologie du long COVID.

Le locus FOXP4 est associé au long COVID.

Le lien entre le locus FOXP4 et le long COVID a été établi. La fatigue, l'essoufflement et des problèmes cognitifs tels que des troubles de la mémoire et de la concentration sont les symptômes prédominants de cette condition. Une méta-analyse GWAS complète a révélé une association génétique significative avec le long COVID dans la région chromosomique 6, située en amont du gène FOXP4. Plus précisément, la présence de l'allèle rs9361706-C a été associée à un risque 1,63 fois plus élevé de développer un long COVID.

Une méta-analyse GWAS complète a révélé une association génétique significative avec le long COVID. (Lammi et al., 2023)

FOXP4 présente des niveaux d'expression élevés dans le poumon et montre une corrélation avec la gravité de la COVID-19.

Dans le contexte des variantes associées au LONG COVID dans une région de 100 kb, l'allèle rs12660421-A d'ascendance européenne a été trouvé lié à l'allèle de risque LONG COVID, rs9367106-C. Cette association a été de plus liée à une expression accrue de FOXP4 tant dans les poumons que dans l'hypothalamus. Notamment, FOXP4 était exprimé de manière particulièrement abondante dans les cellules alvéolaires de type 2, suggérant leur implication dans la régulation immunitaire au sein des poumons. De plus, FOXP4 montrait une expression presque également élevée dans les granulocytes, qui jouent également un rôle dans la régulation des réponses immunitaires innées.

Le long COVID semble être une maladie hétérogène, influencée à la fois par des variations génétiques individuelles et par des facteurs de risque environnementaux contribuant à la susceptibilité à la maladie. (Lammi et al., 2023)

La complexité de l'association de FOXP4 avec le long COVID va au-delà d'une simple explication par la gravité de la COVID-19 aiguë.

Des recherches antérieures ont indiqué que la gravité de la COVID-19 pourrait agir comme un facteur de risque pour

long COVID. Pour explorer le lien entre l'hospitalisation due à la COVID-19 et le long COVID, les chercheurs ont réalisé une analyse MR à deux échantillons. Cependant, les résultats ont révélé que le long COVID et l'hospitalisation due à la COVID-19 étaient des conséquences de la même infection sous-jacente, rendant difficile l'établissement de l'hospitalisation due à la COVID-19 en tant qu'exposition causale. Notamment, FOXP4 a montré une association plus forte avec le long COVID que prévu, indiquant que sa corrélation avec la susceptibilité ou la gravité à elle seule ne pouvait pas expliquer pleinement son rôle dans le long COVID.

Résumé

Cette étude présente des preuves génétiques convaincantes soutenant l'implication cruciale de la pathophysiologie pulmonaire dans le développement du long COVID. De plus, elle identifie des variants génétiques au sein du locus FOXP4 comme des facteurs de risque significatifs pour le long COVID. Ces résultats s'alignent avec des rapports épidémiologiques et cliniques antérieurs sur le long COVID, soulignant sa nature polygénique. Comme d'autres conditions post-virales, le long COVID semble être une maladie hétérogène, influencée à la fois par des variations génétiques individuelles et des facteurs de risque environnementaux contribuant à la susceptibilité à la maladie.

Référence:

1. Lammi, Vilma, et al. "Étude d'association à l'échelle du génome sur le Long COVID." medRxiv (2023) : 2023-06.