SUGAR-seq permet la détection simultanée des glycanes, des épitopes et du transcriptome dans des cellules uniques.

19 février 2021

Résumé

Le séquençage d'ARN à cellule unique multimodal permet le cartographie précise des caractéristiques transcriptionnelles et phénotypiques des états de différenciation cellulaire, mais ne permet pas l'intégration simultanée de données critiques sur les modifications post-traductionnelles. Ici, nous décrivons le séquençage de glycanes et d'ARN de protéines de surface (SUGAR-seq), une méthode qui permet la détection et l'analyse de la glycosylation N-liée, des épitopes extracellulaires et du transcriptome au niveau de la cellule unique. L'analyse intégrée de SUGAR-seq et du glycoprotéome a identifié des cellules T infiltrant les tumeurs avec des propriétés glycanes de surface uniques qui rendent compte de leur état épigénétique et fonctionnel.

Plus d'infos sur : https://advances.sciencemag.org/content/7/8/eabe3610